根據(jù)國家美國食品藥品監(jiān)督管理局發(fā)布的《2019年下半年北京市藥品質(zhì)量安全公告》，馬應(yīng)龍醫(yī)藥集團(tuán)有限公司生產(chǎn)的“紅霉素軟膏”(批號190126)在北京市藥品檢驗(yàn)所“含量測定”中被檢出不合格，送檢來源為北京宣內(nèi)藥業(yè)有限公司，黑龍江葵花藥業(yè)有限公司生產(chǎn)的“銀翹傷風(fēng)膠囊”(批號20181002)批號不合格，送檢來源為北京孟靜匯康

馬應(yīng)龍醫(yī)藥集團(tuán)股份有限公司此前曾因產(chǎn)品不合格登上“黑榜”:2017年5月11日，中國食品藥品監(jiān)督管理總局發(fā)布的《總局關(guān)于11批次不合格藥品的通報(bào)(2017年第74號)》顯示，馬應(yīng)龍生產(chǎn)的地奧司明片(批號150609)被大連市藥品檢驗(yàn)所檢出“含量測定”不合格，檢驗(yàn)來源為華東醫(yī)藥湖州有限公司

2018年至2019年，馬應(yīng)龍投資的成都?xì)W康制藥有限公司因環(huán)境違法被處罰兩次。