衛生部于2011年6月8日發布了2011年全國法定傳染病疫情。據數據顯示,除了臺灣、香港和澳門地區外,6月份全國共報告法定傳染病823318例,其中死亡1522人。在6月1日至6月30日24時期間,甲類傳染病中共報告霍亂發病5例,但無人死亡。而在乙類傳染病中,除了傳染性非典型肺炎、脊髓灰質炎、人感染高致病性禽流感、白喉等疾病外,其他22種傳染病共報告發病350131例,死亡1422人。報告發病數排名前五的病種依次為病毒性肝炎、肺結核、梅毒、細菌性和阿米巴性痢疾、猩紅熱,這些疾病占乙類傳染病報告發病總數的93%。

另外,全國共報告丙類傳染病發病473182例,其中100人因報告的丙類傳染病而死亡。報告發病數排名前三位的病種依次為手足口病、其他感染性腹瀉病和流行性腮腺炎,這些疾病占丙類傳染病報告發病總數的96%。