截至2020年2月26日,2019-nCoV已經在超過26個國家感染了超過77,000人,奪走了超過2,000條生命。2019-nCoV是一種引起新冠肺炎的新型冠狀病毒,與SARS-CoV高度相似。目前,還沒有針對2019-nCoV或任何形式冠狀病毒的疫苗獲得批準。
最近,斯坦福大學醫學院的陳彬彬和伊森法斯特在預印本網站bioRxiv上發表了一篇題為“2019年潛在的T細胞和B細胞事件-NCOV”的新文章。在這篇論文中,研究人員使用結構生物學和機器學習的計算工具,根據病毒蛋白質的抗原抗體結合特性,識別2019-nCoV的T細胞和B細胞表位。這些表位可用于開發更有效的疫苗和鑒定中和抗體。
研究人員在人類MHC-I和MHC-II等位基因中鑒定了405個具有良好抗原表達分數的病毒肽,并在2019-nCoV S蛋白的受體結合結構域附近發現了兩個潛在的中和B細胞表位(440-460和494-506)。通過分析來自四大洲的68個病毒基因組的突變譜,研究人員發現了96個編碼突變。這些突變更有可能發生在MHC-I評分高的地區(p=0.02)。S蛋白受體結合區附近沒有突變。最后,研究人員用SARS-CoV的實驗數據驗證了我們的計算方法。
參考資料:
陳彬彬等人。2019-nCoV的潛在T細胞和B細胞表位。bioRxiv。doi:https:///10.1101/2020 . 02 . 19 . 955484
本文來自生物谷。更多信息,請下載生物谷APP()