肝癌在世界范圍內死亡率居世界第二位，但治療方案仍然有限。要了解更多關于這種癌癥的遺傳原因，并確定潛在的新的治療靶點。一個全球范圍內的基因組學研究團隊，由癌癥基因組學總監David Wheeler和人類基因組測序中心（HGSC）教授共同領導 。研究分析了全球各地的363例肝癌病例，通過DNA甲基化、RNA轉錄和蛋白表達分析肝癌患者的基因組突變以及表觀遺傳改變情況。 該研究日前發表在Cell雜志上。

作為大型癌癥基因組圖譜項目（TCGA）的一部分，該研究工作是第一次大規模的多平臺分析觀察腫瘤的多個維度。 “過去曾在肝癌中進行了大量的研究，但是它們主要限于腫瘤的一個方面：基因組突變。現在研究人員通過觀察腫瘤的各種分子特征，可以在分子水平上對腫瘤手術有更加深入的了解 ”Wheeler說。

“我們在Baylor有一個非常活躍的肝癌社區，所以我們有一個很好的機會與他們合作，并從他們對肝癌的見解中獲益。” Wheeler說。 在肝臟的許多關鍵功能之中，肝細胞對白蛋白和尿素的產生至關重要。 弄清肝癌細胞如何關閉這些功能，達到其自身腫瘤生長和細胞分裂的目的是令人瘋狂的。

Bayle分子細胞生物學助理教授兼該研究的共同作者Karl-Dimiter Bissig指出：“有趣的是，我們發現氨甲酰磷酸合成酶高度甲基化下調，而胞質氨基甲酰磷酸合酶II被上調。這可能是肝癌的合成代謝需要，重新編程谷氨酰胺途徑以有利于嘧啶產生從而潛在地促進DNA復制，這對癌細胞有益。”

多個數據平臺與臨床數據相結合，使研究人員能夠將腫瘤分子特征與臨床特征相關聯，從而深入了解其分子和基因的作用，以幫助設計新的治療方法。

人類基因組測序中心主任Richard Gibbs博士說：“這是分析癌癥頻率增加的杰出研究，特別是在德克薩斯州。值得注意的是，預測患者結局的基因表達特征的觀察是本研究的顯著成就，結果非常具有潛力，標志著治療這種癌癥的轉折點。”HGSC也是該項目的DNA序列生產中心。

參考資料

Adrian Ally et al. Comprehensive and Integrative Genomic Characterization of Hepatocellular Carcinoma, Cell (2017). DOI: 10.1016/j.cell.2017.05.046

文章原標題：Cell：讓“基因”和“癥狀”之間劃等號！尋找新型療法！